A medida que ha ido aumentando la complejidad de los problemas analíticos ha sido necesario disponer de técnicas de separación cada vez más efectivas y que puedan ser llevadas a cabo en el menor tiempo posible. A pesar de que los primeros instrumentos comerciales fueron introducidos en el mercado hace sólo 9 años, la Electroforesis Capilar (EC), basada en la separación de los componentes de una muestra a través de un capilar por la acción de un campo eléctrico, se ha convertido en una de las técnicas de separación más populares, debido a la gran eficacia y resolución en tiempos muy cortos y con volúmenes de muestra y reactivos muy pequeños, lo que da lugar a bajos costes y mínima contaminación ambiental.
La gran ventaja de la EC frente a otras técnicas ampliamente difundidas como la cromatofrafía líquida de alta resolución es que en ésta, la aplicación de los distintos modos de separación implica un cambio en la columna y en la fase móvil, mientras que todos los modos de EC, que permiten separar componentes cargados y no cargados de muy distinta naturaleza, se llevan a cabo con el mismo capilar y cambiando, únicamente, el tipo de medio electroforético.
Dentro de los campos de aplicación de mayor desarrollo de la técnica, el más apasionante, tanto para bioquímicos como para químicos analíticos, es el estudio del genoma humano, ya que las separaciones de ácidos nucleicos, nucleósidos y oligonucleótidos, permiten evolucionar en muchos aspectos realcionados con la erradicación de enfermedades como el cáncer o el SIDA, ambos campos de una importancia extraordinaria.
